À l’Époque Romaine, les routes extra-urbaines étaient généralement longées de nécropoles et, à environ un kilomètre au nord de Tharros, sur le site actuel de San Giovanni di Sinis, une nécropole d’abord païenne, puis chrétienne, a été construite.  Cette zone de cimetière a été le lieu de construction, vraisemblablement entre le VIe et le VIIe siècle apr. J.-C. d’une petite basilique paléochrétienne, dont les vestiges ont été retrouvés sous l'actuelle église San Giovanni et qui lui servent de fondation (fig. 1-3).

Fig. 1 - Localisation de l’église San Giovanni par rapport à Tharros : A) l’église ; B) Su Muru Mannu (Google Earth. Réélaboration C. Tronchetti)

Fig. 2 - Église San Giovanni (photo Unicity S.p.A.)

Fig. 3 - Plan de l’église San Giovanni avec les restes des structures préexistantes (MESSINA, MUREDDU 2002, p. 241)

L’aspect actuel de l’église est le résultat de la transformation du premier édifice, organisé selon un plan en croix.  Les bras longitudinaux ont été coupés ; le bras Est a été transformé en abside et trois nefs ont été aménagées à l’intérieur de l’église (fig. 4-8).

Fig. 4 - Plan de l’église San Giovanni (CORONEO 1999, p. 38)

Fig. 5 - L’église San Giovanni (photo Unicity S.p.A.)

Fig. 6 - Façade de l’église San Giovanni (photo Unicity S.p.A.)

Fig. 7 - Abside de l’église San Giovanni (photo Unicity S.p.A.)

Fig. 8 - Détail d’une fenêtre bifore condamnée (photo Unicity S.p.A.)

À noter qu’une grande partie des blocs de pièce utilisés pour la construction aussi bien du premier édifice lié à la nécropole que de l’église par la suite, ont été récupérés de la ville de Tharros, alors dégradée, selon une pratique bien documentée sur de nombreux autres sites.

L’église San Giovanni, dans ses formes actuelles, a été datée génériquement à l’Époque Proto-Romane, autour du X-XIe siècle, selon les caractéristiques structurelles de l’abside et par la présence des fenêtres bifores dans l’abside et le transept.